Первый номер «Журнала Московской Патриархии» вышел 12 сентября 1943 года, в день интронизации Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Сергия. На первой же странице редакция знакомила читателей с основной тематикой и направлением журнала. Говорилось, что он «будет содержать официальные распоряжения Святейшего Патриарха по церковным вопросам, послания и определения Святейшего Патриарха и Священного Синода, патриотические выступления Святейшего Патриарха и других церковных деятелей, статьи богословского характера, календарные сведения и различные заметки, касающиеся жизни Церкви».
В течение всех лет издания Журнал был голосом Церкви, несущим слово евангельского благовестия, бесценным источником информации о событиях церковной жизни. Он внес существенный вклад в дело подготовки будущих православных церковно- и священнослужителей, в дело христианского воспитания и просвещения церковных людей, сохранения чистоты православной веры.
Сегодня в «Журнале Московской Патриархии» отражаются все сферы современной церковной жизни, в том числе проблемы духовного образования, пастырского попечения, социального служения Церкви, ее взаимодействия с Вооруженными Силами, миссионерской работы. На страницах Журнала можно прочитать как о первосвятительских поездках Святейшего Патриарха, так и о трудах и заботах небольшой церковной общины. В нем публикуются статьи по всем разделам богословия, проповеди, церковно-исторические работы, библиографические обзоры.
